Laboratorio di formazione insegnati per Liceo Juvarra, Venaria (TO) sull'utilizzo di software nell'ambito delle biomolecole
Public Engagement Sono stati illustrati i software disponibili e freeware per la visualizzazione di biomolecole (https://www.scijournal.org/articles/online-tools-to-draw-molecular-diagram?utm_content=cmp-true) e macrobiomolecole (ChemSketch, SwissPDB viewer, UCSF Chimera, Pymol) con particolare attenzione alle strutture di proteine e i relativi databases, es. Protein Data Bank (https://www.rcsb.org/) e le risorse per l’insegnamento del sito PDB 101. Inoltre sono state presentate le potenzialità e le modalità di utilizzo degli algoritmi di AI per la predizione delle strutture proteiche (AlphaFold2 e 3).
Lezione 1:
Introduzione ai software base di disegno piccole biomolecole e elementi schematici biologia (BioRender). Teoria e esercitazioni pratiche di uso
Lezione 2: banche dati di strutture di macromolecole e loro semplice visualizzazione. Risorse aggiuntive PDB 101 e occasioni di percorsi interdisciplinari (es. Protein Art).
Lezione 3: utilizzo di Swiss PDB Viewer, UCSF Chimera e Pymol
Lezione 4: Introduzione all’algoritmo DeepMind applicato alla predizione di strutture di proteine e al docking di ligandi (AlphaFold 2 e 3) e esempi di applicazione.
Sede dell’iniziativa:
Liceo Juvarra, Venaria (TO)
Periodo di svolgimento dell’iniziativa:
Febbraio 18, 2025 - Marzo 18, 2025